مطالعه ساختاری یک آنالوگ پپتید brevinin-2r بوسیله nmr
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس
- نویسنده زهرا تارخ
- استاد راهنما حسین نادری منش مجید عرفانی مقدم
- تعداد صفحات: ۱۵ صفحه ی اول
- سال انتشار 1389
چکیده
پپتیدهای ضد میکروبی با هدف قرار دادن غشا سبب از بین سلولهای میکروبی می شوند. این پپتید ها خاصیت دوگانه دوست دارند به طوری که بخش آبگریز آنها داخل غشا و بخش باردار آنها با فسفولیپیدها بر هم کنش می دهد.پپتید brevenin-2r از ترشحات پوست قورباغه rana ridibunda بدست آمد. این پپتید دارای 25 آمینواسید است. مطالعات ساختاری بوسیله cd نشان داد که این پپتید در محیط آبی بدون ساختار ودر محیط های آب گریز ساختار مارپیچ آلفا به خود می گیرد. بعلت کوچکی وپایین بودن میزان هیدروفوبیسیته ،این پپتید خاصیت همولیز ندارد. این مطالعه برروی ساختار پپتید سنتزی آنالوگ بروینین2r- صورت گرفته است این پپتید 24اسید آمینه دارد وحاوی یک پل دی سولفید در انتهای کربوکسیل خود می باشد.چهارآمینواسید لوسین در این پپتید به فرم d لوسین می باشند وتوالی آن klkfakgvaqsllnkascklsgqc می باشد. از نمونه حل شده در dmsoدوتره در دو دمای 27و30 درجه طیف های tocsyوnoesy گرفته شد.پس از شناسایی سیستم های اسپینی واسیدهای آمینه در توالی،محاسبه ساختار سه بعدی توسط برنامه dyana انجام شد. برای تعیین ساختار پپتید در انتهای آمین،مدلسازی بر اساس پپتید گاگورین-4 صورت گرفت و در نهایت پس از مینیمم سازی انرژی ساختار نهایی بدست آمد.برای اطمینان نتایج از threadingو پیشگویی ساختار با استفاده از جابجایی شیمیایی 1h? و1hn استفاده شد.دومارپیچ مجزا در محدوده ی آمینواسیدهای 6-2و15-12 بخش قرار گیرنده در غشای این پپتید را تشکیل می هد و انتهای کربوکسیل آن به شکل لوپ حاوی پل دی سولفیدی است و بدلیل داشتن لیزین با بار مثبت با فسفولیپید های غشایی بر هم کنش می دهد
منابع مشابه
بررسی خصوصیات آنتی اکسیدانتی پپتید Brevinin 2R متصل شده به نانو ذره اکسید سریم
مقدمه: پپتید بروینین 2آر یک پپتید کاتیونیک است که از ترشحات غدد پوستی قورباغه مردابی Rana ridibunda استخراج شــده اســت. ایــن پــپتــید دارای خــواص ضــد میکــروبــی و ضــد ســـرطانی اســت و دارای تــوالــی KLKNFAKGVAQSLLNKASCKLSGQC است. نانوذرات اکسید سریوم(نانوسریا) شکل اکسید شده عنصر کمیاب سریوم هستند که به دلیل تغییرات جای خالی اکسیژن سطحی و آرایش ظرفیتی می توانند به عنوان جاروب کننده های...
متن کاملBrevinin-2R-linked polyethylenimine as a promising hybrid nano-gene-delivery vector
Objective(s): Polyethylenimine (PEI) is one of the most widely used polymers in gene delivery. The aim of this study was to modify PEI by replacing some of its primary amines with Brevinin 2R (BR-2R) peptide in order to increase the efficiency of gene delivery.Materials and Methods: Polyethylenimine was modified by BR-2R peptide by two d...
متن کاملسنتز شیمیایی فاز جامد brevinin۲r و دیاسترومر آن به عنوان پپتید ضد باکتریایی ومطالعه ساختار-فعالیت
ترشحات سطح پوست دوزیستان سرشار از ترکیبات مختلف است . برخی ترکیبات دارای عملکرد فیزیولوژیک و برخی دیگر که دارای فعالیت ضد میکروبی هستند بخشی از دفاع اولیه دوزیستان را تشکیل می دهند .در این تحقیق brevinin-2r که حاوی 25 آمینواسید برای اولین بار به صورت فاز جامد در ایران سنتز گردید. brevinin-2r حاوی 25 آمینواسید میباشدکه از پوست قورباغه rana ridibunda ترشح میشود. این پپتید دارای خاصیت ضد باک...
متن کاملAntimicrobial peptide Brevinin-2R induces the secretion of a pro-inflammatory cytokine in HepG2 cells
Introduction: Antimicrobial peptides as the body's defense strategy play an important role in resistance against infection of microorganism. These peptides are able to modulate the immune and inflammatory processes through the production of defensive molecules. Therefore, the modulatory effects of Brevinin-2R, an antimicrobial peptide extracted from the skin of the frog (Rana ridibunda), was ev...
متن کاملبررسی اثر کشندگی پپتید بروینین-2R بر سلولهای اسکواموس کارسینوم دهانی
Background and Objective: Peptide as an agent in manufacturing new drugs has recently been taken into consideration. Brevinin-2R is a nano peptide with a wide range of biological actions. Thus, the current study was designed in order to evaluate the in vitro effects of Brevinin-2R on oral squamous cell carcinoma cells in comparison to normal mice fibroblast cells. Materials and Methods: In t...
متن کاملطراحی و سنتز شیمیایی آنالوگ پپتید brevinin-18 با تکنیک فاز جامد و سنجش فعالیت ضدباکتریایی آن.
پپتید brevinin-18 یک نوع ناقص "truncated " از brevinin-1e می¬باشد که خاصیت ضدباکتریایی فرم آمیدی آن به اثبات رسیده است. در این پژوهش بر اساس اصول پپتید تقلیدی آنالوگی برای brevinin-18 طراحی شد سپس با روش فاز جامد spps به صورت شیمیایی سنتز شد.خالص سازی با دستگاه hplc وبا ستون¬های فاز معکوس vydac انجام شد. اثرات ضدمیکروبی آن بر روی چند گونه باکتری مورد بررسی قرار گرفت وبا پپتید brevinin-18 مقایسه...
15 صفحه اولمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023